我军在占领蒙古的全境以后，陈长捷的“归绥方面军”全部进入蒙古境内，沿着苏蒙边境线建立了防御纵深，大批的装甲和骑兵部队部署在蒙古，并在库伦（乌兰巴托）机场驻有两个飞行大队。
东起我国东北地区的满洲里，西至我国新疆的阿勒泰地区，一千多公里的苏蒙边境线，建立起无数的边防哨所，我军先进的通讯装备将苏军的动向，随时报告至方面军司令部。
由于苏军驻扎的距边境线较近，在得到我军进入蒙古的消息后，基本上没有同我军发生大规模正面冲突，很快地撤回苏联境内。因此，郭景云的第15军和傅作义的第21军，除了部分兵力负责边境的守备外，抽调大量的力量在蒙古境内进行彻底地清剿，为我国打出一块稳定的战略缓冲地带。凡是拒不投降继续抵抗的零星蒙古军队，以及形形色色的草原骑匪，都遭到了空前严厉地打击。
我军痛定思痛，决心彻底铲除分裂势力的生存土壤，消灭蒙古境内所有不安定的因素。将原蒙古部长会议的官员全部押解南京监禁，在居民聚集地散发传单和张贴告示，勒令蒙古人民军的军人在指定的时间内，到指定的地点集中缴械。
凡是按照我军要求，主动放下武器的蒙古军人，一律给予宽大优待，并在将来给予中国公民的待遇。凡是未能按照规定时间缴械的人员，在同我军遭遇后，我军仍然给予放下武器的机会劝降三次，敢于继续抵抗者将遭到被消灭的命运，我军将拒绝接受投降。由于蒙古从中国分裂出去的时间不长，再加上苏联被德国和倭国两面夹击，再也没有了昔日的强大和威风，接受强大而富裕的中国统治，对蒙古人民来说并没有太大的抵触，绝大部分的武装都主动向我军投诚。但是，也有少数政治色彩浓厚的土匪，无视我军的反复警告和规劝，仍然继续打家劫舍甚至袭击我军的小部队。
在我军收复了内蒙和东北之后，原来活动在这些地区的土匪部队，除了部分被我军剿灭和劝降解散以外，有相当一部分土匪过惯了无法无天，自由自在，不劳而获的生活，不愿走出山林务农。
但是又慑于我军无情的打击，所以跑到了蒙古境内。仅从中国境内过
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