礼部的刻版作坊开始动工。工人们把余怀真的书稿按页分好，用薄纸覆在上面，仔细描出字形，再反贴到光滑的梨木板上，依着字迹开始雕凿。
刻版的工匠们都是老手，刀法稳当，从不去改动原稿上的字句，只在笔画残缺处稍作补正。
余怀真没有去作坊看他们刻版，但每天傍晚都会有人把当天刻好的样纸送到他的住处，让他核对。他就着窗口的余晖一页一页翻过去，偶尔会用朱笔圈出某个刻偏的笔画，让人第二天改过来。
正月末，第一卷的刻版已经完成了大半。余怀真拿到几张印好的样张，在灯下反复看了几遍。纸页上的字清朗分明，比他手写的稿子更有筋骨。他把那些样张整整齐齐地叠好，收进一只干净的木匣子里。
二月初，太医院派人来拜访余怀真。
来的是个四十多岁的太医，姓方，曾在太医院任职多年。
他坐在余怀真对面，没有带什么架子，只是把那几页关于《本草纲目》的批注摆在桌上，开门见山道：“余先生，你这几处批注，有没有更详细的方例？”
余怀真说：“有。”他从桌边取过一沓札记，翻到其中几页，递给方太医。方太医接过来看了很久，偶尔抬起头问几句，余怀真一一作答。
临走时，方太医把那几页札记仔细收好：“余先生，你写的这些东西，值得让更多人看到。”
余怀真送到门口时没有多说什么，只点了一下头。方太医已经走远，拐过街角，衣摆被风掀起一角，又落了回去。
刻版的进度比预想的快。二月末，上中两卷的刻版已经全部完成，下卷也刻到了后半部分。
礼部的人开始提前考虑印数的问题。他们问余怀真打算印，多少册，余怀真说：“不需要太多。几百册就够了。能让需要的人找到就行。”
礼部的人觉得这个数字有些保守，但也没有多劝，只是按五百册的数量拟了预算。消息传到书坊，几家书商开始打听这本书的内容和作者。
有人听说这是一本医书，又听说作者曾经给太上皇治过病，便觉得这书一定好卖。有人私下找到余怀真，问他愿不愿意把书交给他们来发行。余怀真婉拒了：“这是朝廷出的书，我不做主。”
书商们悻悻而归，但关于这本书的议论并没有停下来。
方太医后来又来了两次，每次都会带一两
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